Résumé de la saison

Le groupe de survivants tente de rejoindre un camp de réfugiés, quittant Atlanta. Bloqué sur une autoroute, il se retrouve confronté à une énorme horde de rôdeurs qui l'oblige à se cacher. La petite Sophia panique et s'enfuit, le groupe s'organise donc pour la rechercher. Lors de ces recherches, plusieurs discordes apparaissent : Andrea en veut terriblement à Dale de ne pas l'avoir laissée mourir au CDC tandis que T-Dog, dans les vapes suite à une infection due à une grave blessure, commence à croire que le groupe pourrait l'abandonner. Carl, le fils de Rick, se fait accidentellement tirer dessus par un chasseur, Otis. Il est emmené d'urgence dans une ferme pour recevoir des soins médicaux. Le groupe fait donc la connaissance d'Hershel Greene, de ses filles Maggie et Beth ainsi que de Patricia, la femme d'Otis, et Jimmy, le petit-ami de Beth. Les habitants de la ferme et les survivants vont donc apprendre à vivre ensemble puis à partager leurs secrets. Pour sauver Carl, Shane se rend en ville avec Otis pour trouver tout ce dont Hershel a besoin pour sauver Carl. Dans leur course, ils se retrouvent dans le pétrin, encerclés par un groupe de rôdeurs, Shane sacrifie Otis qui se fait tuer et part pour la ferme avec les médicaments. Parallèlement, Daryl prend très à cœur les recherches pour retrouver Sophia et se rapproche petit à petit de Carol.
Lori apprend qu'elle est enceinte mais garde le secret pour le moment. Glenn quant à lui développe une relation basée sur le sexe avec Maggie avant de réellement commencer une relation amoureuse avec elle. Dale, qui avait déjà surpris Shane arme à la main visant Rick dans la première saison, a de plus en plus de soupçons quant à son histoire concernant le soi-disant sacrifice d'Otis. Pendant l'une des dernières recherches pour Sophia, Shane et Andrea finissent par coucher ensemble sans qu'il n'y ait rien de sérieux entre eux par la suite. Glenn découvre avec stupéfaction que la grange est remplie de rôdeurs et l'avoue au groupe. Estimant qu'il s'agit d'un danger, Shane ouvre les portes de la bâtisse et libère les rôdeurs pour les tuer. Viennent à ses côtés Andrea, Daryl, Glenn et T-Dog. Alors que le massacre est terminé, un dernier individu sort de la grange : Sophia. Choqués, aucun d'entre eux n'a la force d'abattre la petite fille. Rick s'avance alors et achève Sophia sous les yeux de Carol, anéantie sur le sol. Ceci marque réellement un tournant pour le groupe et son histoire, la mort de la petite fille étant une épreuve difficile à surmonter surtout après des jours passés à la chercher alors qu'elle était dans la grange tout ce temps, à quelques mètres d'eux.
Après ce terrible drame, le groupe est sous le choc. Carol est effondrée et refuse d'assister à l'enterrement de sa fille tandis qu'Hershel, qui gardait dans la grange ceux de sa famille qu'il pensait être seulement malades et capable d'être guéris, quitte la ferme pour la ville dans le but de renouer avec l'alcool. Rick et Glenn, bien que bouleversés, décident d'aller le chercher au bar, sa fille Beth étant en état de choc, mais tombent sur deux hommes qui tentent plus tard de les tuer. Rick les tuera avant, ce qui représente les deux premiers humains tués par Rick de la série. Le groupe de ces deux hommes prend ensuite d’assaut le bar ou se trouve Rick, Glenn et Hershel. Dans leur fuite, ils tuent plusieurs hommes et en ramènent un avec eux à la ferme dans le but de le faire parler sur son propre groupe. Lori, qui était partie chercher son mari à un accident de voiture et manque de se faire tuer par plusieurs rôdeurs qu'elle tue in-extremis. Shane la retrouve, la ramène à la ferme et fait comprendre à tous que Lori est enceinte, ce qui ne manque pas d'étonner le groupe. Beth, qui sort petit à petit de son état de choc après le carnage de la grange et la mort définitive de sa famille, fait comprendre à Maggie son envie de mourir mais y renoncera après une tentative de se suicide. Torturé par Daryl et Shane, Randall, le prisonnier, avoue les terribles pratiques de son groupe en insistant sur le fait qu'il n'y ait pas participer. Rien de plus n'est dévoilé par ce dernier. Une décision doit être prise : il devra soit être libéré loin de la ferme soit être exécuté. Seul Dale puis Andrea proposent de le laisser en vie et le groupe prends la décision de le tuer. Au même moment, Dale est tué par un rôdeur qui plus tôt s'était libéré d'un marécage par la faute de Carl. En hommage à Dale, Rick décide finalement de laisser Randall en vie ce qui crée un nouveau conflit avec Shane qui pense, à partir de ce moment, que Rick ne peux plus diriger le groupe étant devenue une menace qui pourrait conduire à leur perte. Lori avoue à Rick son aventure avec Shane pendant qu'elle le pensait mort. Elle lui dévoile également être enceinte. Suite à ce nouveau choc, Rick finit tout de même par pardonner sa femme, comprenant la "situation". Malgré tout, sa relation avec Shane ne cesse de se dégrader jusqu'à une bagarre qui manque de les tuer tous les deux en attirant des rôdeurs alors qu'ils comptaient abandonner Randall dans la nature. Shane tue finalement Randall dans la forêt quelques jours plus tard, fait croire à sa fuite et attire Rick dans un coin reculé pour l'assassiner. Seulement Rick est plus rapide et le tue avant, non sans s’effondrer sur son cadavre. Carl arrive à ce même moment et abat Shane, transformé en rôdeur malgré aucune morsure ou blessure. Le coup de feu attire une immense horde de rôdeurs vers la ferme : la grange est détruite, la maison est perdue tandis que Patricia et Jimmy perdent la vie. La croyant morte, la groupe s'échappe en laissant Andréa au beau milieu de la horde. Le groupe se réunit à l'endroit de l'autoroute où ils avaient perdu Sophia pour faire état des disparus et reprendre la route. Rick en profite alors pour leur avouer avoir tué Shane qui était devenu une menace et leur révèle ce que Jenner lui avait dit au CDC : n'importe qui, mort ou vivant, est contaminé par le virus et se transformera en rôdeur à sa mort, à moins que le cerveau ne soit touché. Parallèlement, Andréa qui a parcouru la forêt toute la nuit pour échapper aux rôdeurs s’effondre par terre, à bout de forces. Alors qu'un dernier rôdeur s'apprête à la tuer, une mystérieuse personne dont l'identité est cachée par une cape, lui sauve la vie, armée d'un katana et accompagnée de deux rôdeurs.
Rick annonce ensuite au groupe qu'il est désormais leur chef et qu'ils ne sont plus en démocratie. Alors que la situation est au bord de l'explosion, le paysage non loin de là se laisse découvrir : une prison fait son apparition.